El sorteo para la Fase de Grupos de los torneos continentales se realizará el 17 de marzo.
Los 32 equipos (siendo 28 equipos clasificados directamente, más los 4 equipos clasificados de la Fase 3), que se dividirán en 8 grupos de 4 clubes cada uno, disputarán la Fase de Grupos.

La composición de los grupos se establecerá el día del Sorteo de acuerdo con los campeones de la CONMEBOL Libertadores 2024, CONMEBOL Sudamericana 2024 y el Ranking de CLUBES CONMEBOL de 16 de diciembre de 2024:

a) El equipo Campeón de la CONMEBOL LIBERTADORES 2024, será colocado directamente como cabeza de serie del Grupo A.

b) A fin de establecer las cabezas de serie de los 7 Grupos restantes (B al H), se utilizará el Ranking de CLUBES CONMEBOL de 16 de diciembre de 2024. Los 7 clubes cabezas de serie de los Grupos B al H, serán los equipos posicionados en las primeras 7 ubicaciones según el referido Ranking, excluyendo la posición del equipo Campeón de la CONMEBOL Libertadores 2024.

c) La segunda línea estará compuesta por el último Campeón de la CONMEBOL Sudamericana 2024, más los 7 equipos subsecuentes del Ranking de CLUBES CONMEBOL del 16 de diciembre de 2024.

d) La tercera línea se formará por los 8 equipos subsecuentes del Ranking de CLUBES CONMEBOL del 16 de diciembre de 2024.

e) La cuarta línea se conformará de 4 equipos provenientes de la Fase 3 (G1, G2, G3 y G4) más los 4 equipos subsecuentes del Ranking de CLUBES CONMEBOL del 16 de diciembre de 2024.

f) En la Fase de Grupos cada equipo jugará un partido en condición de local y un partido en condición de visitante contra cada uno de los otros equipos del mismo grupo.
g) Los equipos ubicados en primer y segundo lugar de cada grupo se clasificarán para la Fase de Octavos de Final.

h) Los 8 equipos ubicados en la tercera posición en sus respectivos grupos clasificarán a la Fase de Playoffs de Octavos de Final de la CONMEBOL Sudamericana 2025.

Nota: En caso de que el Campeón de la CONMEBOL Sudamericana 2024 por su ubicación en el ranking de Clubes de la CONMEBOL al 16 de diciembre de 2024 le correspondiere ser cabeza de serie, prevalecerá dicha posición y privilegio otorgado por Ranking ante su condición de campeón de CONMEBOL Sudamericana, ubicándose dentro de los clubes de 1ª línea.